ความรู้ความเข้าใจเกี่ยวกับโครงสร้างและการทำงานของโปรตีนในเชื้อไวรัสโควิด-19 (COVID-19) มีความสำคัญต่อการพัฒนายารักษา เมนโปรติเอสชนิดสามซีไลค์ (3C-like main protease) จากเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 เป็นโปรตีนสำคัญที่มีแนวโน้มจะใช้เป็นโมเลกุลเป้าหมายของยา เนื่องจากเป็นโปรตีนสำคัญที่อยู่ในกระบวนการเพิ่มจำนวนและแบ่งตัวของไวรัส จากรายงาน พบว่า ประสิทธิภาพการทำงานของโปรตีนลดลงเมื่อเปลี่ยนจากสภาวะ pH ที่เป็นกลางไปเป็นสภาวะกรด กลุ่มวิจัยของ ศ.ดร.พรเทพ ได้ศึกษาโครงสร้างของโปรตีนด้วยการจำลองพลวัติเชิงโมเลกุล พบว่าโปรตีนมีบริเวณที่แสดงความแตกต่างทางโครงสร้างระหว่างสภาวะทั้งสองอย่างชัดเจน ในสภาวะที่เป็นกรด โครงสร้างของโปรตีนมีเสถียรภาพลดลง และสามารถระบุกรดอะมิโนที่สูญเสียพันธะไฮโดรเจนและอันตรกิริยาภายในโมเลกุลที่สำคัญซึ่งอาจนำไปสู่การแยกไดเมอร์ของโปรตีน
- Pornthep Sompornpisut
- R.B. Pandey
- Panisak Boonamnaj